Açıkta Satılan Baharatlarda Escherichia Coli O157:H7 ve Salmonella Spp. Varlığının Moleküler Mikrobiyojik Analiz Yöntemi ile Belirlenmesi

Özet

Amaç: Bu çalışmada, açıkta satılan karabiber, kırmızıbiber, kimyon ve sumakta E. coli O157:H7 ve Salmonella spp. varlığının moleküler mikrobiyolojik yöntemle teşhis edilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Örneklerin toplanması için Türkiye’nin yedi farklı bölgesini temsilen iller seçilmiş (İstanbul, İzmir, Ankara, Adana, Samsun, Gaziantep ve Erzurum) ve her ilde üç farklı dükkandan en az 200 g olacak şekilde toplam 84 karabiber, kırmızıbiber, kimyon ve sumak örnekleri satın alınmıştır. Baharatın satışa sunulduğu ortamın sıcaklık ve nem ölçümleri kaydedilmiştir. Ayrıca baharatın nem içeriği de nem analizörü ile belirlenmiştir. E. coli O157:H7 ve Salmonella spp. varlığı analizi ise Foodproof E.coli O157:H7 ve Salmonella spp. analiz kitleri kullanılarak Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PCR) ile gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Hiçbir örnekte E. coli O157:H7 saptanmazken, Salmonella spp. İstanbul’dan alınan bir karabiber örneğinde, İzmir’den alınan bir karabiber örneğinde ve Samsun’dan alınan 3 kırmızıbiber ve 2 sumak örneklerinde saptanmıştır. Patojen bakterilerin teşhisinde kullanılan geleneksel yöntem ile sonuç 3-4 gün içerisinde alınırken, RT- PCR ile yapılan analizde ön zenginleştirme dahil, E.coli O157:H7 analizi yaklaşık 20 saatte (18 saat ön zenginleştirme, 1 saat DNA ekstraksiyonu ve 1 saat RT-PCR analizi ), Salmonella spp. analizi yaklaşık 38 saatte (36 saat ön zenginleştirme, 1 saat DNA ekstraksiyonu ve 1 saat RTPCR analizi) gerçekleştirilmiştir. Sonuç: Bu çalışma, besin güvenliğini ve insan sağlığını tehdit eden patojen bakterilerin RT-PCR ile hızlı ve güvenilir bir şekilde belirlenebileceğini göstermektedir.